입학처(처장 최호성)는 2006학년도 수시1학기 신입생 모집에 이어 수시2학기 및 정시모집 신입생 선발을 위한 모집요강을 확정하여 전국 고등학교에 배포하였다.

모집요강에 따르면, 수시2-Ⅰ학기는 9월 10일(토)부터 23일(금)까지 입학원서를 접수하며, 미술교육·음악교육·체육교육과와 군사학과를 제외한 전 학부(과)를 대상으로 시지역 인문계고교출신자 600명, 기타고교출신자 580명 등 총 1,180명을 선발한다. 선발방법으로는 문화컨텐츠학부와 경호비서학부는 학교생활기록부(이하 학생부) 성적과 면접고사 성적을 각각 50%씩 반영하여 선발하고, 국어교육·영어교육·수학교육과는 1단계에서 학생부 성적으로 3배수를 선발한 후 2단계에서 학생부 성적 80% 면접고사 성적 20%를 합산하여 선발하며, 나머지 학부(과)는 전원 학생부 성적으로만 선발하여 10월 25일 합격자를 발표할 예정이다.

수시2-Ⅱ학기는 11월 24일(목)부터 12월 2일(금)까지 체육특기자를 선발하는 체육교육과를 제외한 사범대 전 학과와 군사학과를 제외한 전 학부(과)를 대상으로 시지역 인문계고교출신자 170명, 기타고교 출신자 120명, 체육특기자 40명, 학교장추천자 80명, 만학자 10명을 포함 총 420명을 모집한다. 선발방법은 일반학생(인문계 및 기타고교출신자)과 학교장추천자는 학생부 성적으로 100% 선발하며, 체육특기자는 경기성적만으로, 만학자는 학생부 성적 90%와 나이 10%를 합산하여 선발, 12월 16일(금) 합격자를 발표할 예정이다. 수시2-Ⅰ과 2-Ⅱ모집의 일반학생 전형의 학생부 반영방법은 교과성적 90%, 출석성적 10%를 반영하며, 교과성적은 1학년 국민공통 기본교과와 2학년 및 3학년 1학기 선택교과로 구분하여 반영하는데, 1학년 국민공통 기본교과는 전 계열에 걸쳐 국어, 사회(국사 포함), 수학, 과학, 영어교과 중 우수한 3개 과목의 석차를, 2학년부터 3학년 1학기까지의 선택교과는 인문·예체능계열은 인문·사회과목 군(국어교과, 도덕교과, 윤리교과, 사회교과, 국사교과)중 2개 과목의 석차와 외국어과목군 중 우수한 1개 과목의 석차를 반영하며, 자연계열은 과학·기술과목군(수학교과, 과학교과, 기술·가정교과, 실업·가정교과)중 우수한 2개 과목의 석차와 외국어과목군 중 우수한 1개 과목의 석차를 각각 반영하여 선발한다.

정시모집은 12월 24일(토)부터 28일(수)까지 원서를 접수하며 '가'군 모집에 군사학과 40명을, '나'군에 전 학부(과)를 대상으로 1,079명을, '다'군에 사범대학을 제외한 전 학부(과)를 대상으로 434명을 모집할 예정이며, 수시모집 결과에 따라 최종 정시모집 선발인원은 변경될 가능성도 있다. 전형방법은 '가'군의 군사학과는 1단계는 수능성적만으로 2단계는 체력검정, 면접평가 등으로 선발한 후 최종 수능 80%, 체력검정 10%, 면접10%를 합산하여 선발한다. '나'군과 '다'군의 전형방법은 인문·자연계열은 학생부 40%, 수능 60%를, 예·체능계열 및 건강스포츠학과는 학생부 40%, 수능 30%, 실기고사 30%를 합산하여 선발하며, 교과성적의 학년별 반영비율은 1학년 성적 40%, 2·3학년 성적 60%를 각각 반영하고, 교과성적 반영방법은 3학년 2학기까지 교과성적을 대상으로 수시 2학기 신입생모집의 반영방법과 동일하게 반영한다. 정시모집의 예·체능계열 실기고사는 2006년 1월 17일(화)에, 합격자는 2006년 1월 26일에 발표할 예정이며 최초 합격자 등록은 2006년 2월 6일부터 7일까지, 2006년 2월 8일부터 17일까지 추가 합격자 발표 및 등록이 진행된다.